Le travail de thèse de Javier Belinchon-Moreno, consacré à la diversité génétique et fonctionnelle des gènes de résistance chez le melon, a été récompensé ce 9 novembre 2026 par le prix "Science ouverte de la thèse 2026". Cette distinction nationale salue la qualité de ses travaux scientifiques et leur inscription dans une démarche de science ouverte, au service de l'amélioration des plantes.
Attribué par le ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace, en partenariat avec le Comité pour la science ouverte, ce prix ministériel met à l'honneur les jeunes chercheurs qui intègrent les principes de la science ouverte dans leurs travaux doctoraux. En distinguant Javier Belinchon-Moreno, le prix récompense une thèse qui associe une démarche scientifique ambitieuse à la production de connaissances accessibles, soulignant l'intérêt des approches développées pour renouveler l'exploration de la diversité génétique et contribuer aux enjeux de l'amélioration des plantes.
Ce travail, mené au sein des unités INRAE GAFL et EPGV sous la direction de Nathalie Boissot et Patricia Faivre-Rampant, et soutenu en 2025 à l'Université d'Avignon, s'intéresse aux gènes NLR impliqués dans la reconnaissance des pathogènes et la défense des plantes. Une méthode de séquençage ciblé a permis de construire un pan-NLRome sous forme de graphes, représentant la diversité génétique et dépassant les limites d'un génome de référence unique.
Les analyses d’association novatrices ont permis d’identifier un ensemble d’allèles de NLR, dont un quart correspond à des allèles de résistance. Ces résultats révèlent un réservoir d’allèles de résistance potentiels, exploitables dans les programmes de pre-breeding pour développer des variétés capables de résister à plusieurs maladies et ravageurs.
Les méthodes développées, basées sur les k-mers et les nœuds de graphes, fournissent des outils analytiques directement exploitables dans les programmes de pre-breeding et de sélection variétale. Ces approches pourraient également être transposées à d'autres espèces pour valoriser plus efficacement la diversité génétique dans les programmes d’amélioration des plantes.
